Gakuen Toshi egy hatalmas város, teli iskolákkal, loli tanárnőkkel és ki tudja még miféle borzalmakkal. Ebben a városban él a világ egyik legszerencsétlenebb sráca, Kamijyo Touma. A fiút jobb keze bármilyen természetfeletti erőt képes semlegesíteni, ami egy isteni képesség lenne, azonban ez az erő Touma szerencséjét is elűzi. A nyári szünet első napján Touma egy apácát talál az erkélyén, aki Indexnek hívja magát, és aki azt állítja, hogy 103.000 varázskönyvet hord magánál. Index egy vidám, folyton éhes, csupa szív lány, akinek érdekes hivatása van, hiszen ő a mágikus egyház könyvtára! Szörnyen makacs, gyakran elég őrült dolgokat művel, hogy bizonyítsa az igazát. Touma-hoz hasonlóan őt is furcsa erővel átkozta meg a sors, ez pedig a tökéletes memória.